Добавление нового проекта в репозитарий делается командой cvs import...

cvs import [-dX] [-k subst] [-I ign] [-m msg] [-b branch] [-W spec] repository vendor-tag release-tags...

Заходим в папку со своим будущим проетом. cd ~/proect

cvs import -m "метка проекта" название_репозитария  vendor-tag release-tags

Удаление файлов из репозитария cvs

Для удаления файлов нужно сначала удалить файлы из папки, затем зайти в папку с проектом и набрать cvs remove удаленный файл. Затем набрать cvs commit, и оставить комментарий.

Так же можно набрать cvs commit -m "Удалил файлы". После такой команды редактор запусткаться не будет, а метка будет "Удалил файлы"