Обычно, свежеустановленный Gimp летает, быстро запускается сам и быстро отображает панели инструментов, но со временем панели инструментов отображаются всё медленее.

Проблема в том, что Gimp поумолчанию сохраняет настройки панелей инструментов в текстовые файлы, а затем при обращении к инструментам парсит многомегабайтные файлы, применяя совершенно ненужные прошлые настройки.

Для того чтобы сбросить эти настройки достаточно удалить(или переменновать) файлы соответствующих настроек в .gimp-2.6/tool-options/

Мне довелось увидеть 35ти мегабайтный файл gimp-curves-tool.settings (настройки инструмента работы с кривыми), что замедляло открытие панели кривых на несколько секунд, после удаления этого файла Gimp заработал как новый